Бывает, что документ Markdown открывается в Obsidian, а иллюстрации в нём отсутствуют. Заметка импортирована, но файлы, на которые ссылаются её ссылки, остались в другом месте. Результат конвертации PDF в Markdown стоит воспринимать как текст вместе с ресурсами, которые он действительно использует, а не как единый самодостаточный файл.
В описанном ниже порядке действий Obsidian выступает как внешнее приложение для заметок. PDF Craft не синхронизирует экспорт с хранилищем автоматически.
Проверьте скачанный файл, прежде чем что-то переносить
Скачайте готовый результат в Markdown на странице PDF Craft и посмотрите, что именно получили. Если это архив, сначала распакуйте его. Найдите основной документ Markdown и проверьте, ссылается ли он на локальные ресурсы, на внешние адреса или и на то, и на другое. Не рассчитывайте, что во всех случаях конвертации используются одинаковые имена папок.
Откройте файл .md в текстовом редакторе и найдите ссылку на изображение. По её адресу видно, какие ресурсы должны переехать вместе с документом. Путь вроде images/figure-1.png отсчитывается от самого файла Markdown; это не указание Obsidian автоматически скачать иллюстрации из исходного PDF.
Сохраните нетронутую копию скачанного результата. Если при переносе или переименовании ссылки сломаются, вы сможете сравнить файлы с исходной структурой, а не конвертировать PDF заново.
Разместите документ в хранилище осознанно
Выберите папку для исходных материалов, например по одной папке на статью или книгу. В справке Obsidian об импорте Markdown описано, как добавлять файлы через проводник Obsidian или копировать их в хранилище средствами файлового менеджера системы. Используйте способ, который поддерживается на вашем устройстве.
Переносите Markdown и нужные ему ресурсы вместе, сохраняя их взаимное расположение. Не стоит складывать изображения из всех проектов в один каталог с именами вроде image1.png: одинаковые имена могут совпасть, и потом будет трудно понять, откуда взялся файл.
В Obsidian есть настройки расположения вложений для новых файлов. Эти настройки не означают, что все существующие пути в импортированном Markdown уже переписаны. Прежде чем перестраивать папку с ресурсами, проверьте, как ссылки выглядят в самом импортированном документе.
Проверьте заголовки, ссылки и изображения уже в хранилище
Откройте заметку в режиме чтения и просмотрите её структуру. Заголовки должны соответствовать разделам источника, а не повторяющемуся колонтитулу на каждой странице. Затем пройдите по внутренней ссылке на раздел, по ссылке на другую заметку и по внешней ссылке на источник.
Посмотрите одно изображение в начале документа и одно ближе к концу. Сверьте подписи и ссылки на рисунки с исходным PDF. Появление миниатюры в заметке ещё не доказывает, что полное изображение и важные обозначения на нём сохранились.
Если изображение не отображается, проверьте регистр символов в ссылке, расширение файла и расположение папки. Определите, ожидает ли ссылка локальный файл или обращение по сети. Не исправляйте сломанный локальный путь, молча подставляя вместо него случайную картинку из интернета.
О том, как Obsidian работает с вложениями, читайте в руководстве по вложениям. Более общий разбор работы с файлами изображений приведён в статье Ресурсы изображений в Markdown.
Сохраняйте связь цитат с исходным PDF
Добавьте короткую заметку об источнике: название, авторы или издательство, издание или дата, имя исходного файла и нужные страницы. Если напечатанные номера страниц не совпадают с нумерацией в программе просмотра PDF, зафиксируйте это расхождение.
Держите исходный PDF в постоянном месте, доступном в вашем рабочем процессе. Если он лежит вне хранилища, подумайте, что произойдёт при переносе хранилища на другое устройство. Ссылка, которая работает на одном компьютере, может не открыться на другом.
Прежде чем цитировать фрагмент из сконвертированного текста, сверьте его с PDF. Ошибки распознавания попадают в поисковый индекс и находятся так же хорошо, как и правильный текст. То, что заметка поддаётся поиску, ещё не делает приведённую в ней цитату выверенной.
После проверки превратите импорт в рабочие заметки
Когда заметка об источнике в порядке, заведите более короткие заметки по нужным вам мыслям. Переносите в них ссылку на источник и страницу, а не вставляйте отдельные утверждения в посторонние файлы.
Для таблицы сохраняйте её заголовок, единицы измерения и все уточняющие примечания. Для формулы проверьте и само выражение, и то, как его отображает программа, в которой вы его используете. Не позволяйте себе в ходе правки превратить сомнительный фрагмент в факт, который выглядит окончательно установленным.
Следующий этап описан в статьях Работа с PDF в Markdown для исследований и Заметки по отсканированным книгам. Сначала добейтесь воспроизводимого импорта: заметка, ресурсы и путь обратно к PDF должны работать и после того, как вы закроете и снова откроете хранилище.