Markdown文書をObsidianで開いたのに、図版が見当たらないことがあります。ノート自体は取り込まれていても、リンクが参照するファイルが置き去りになっているのです。PDFからMarkdownへの変換結果は、テキストだけで完結したファイルと決めつけず、実際に使われているリソースも含めた一式として扱ってください。
以下の手順では、Obsidianを外部のノートアプリとして使います。PDF Craftが書き出した結果を保管庫へ自動で同期するわけではありません。
移動する前にダウンロードした内容を確認する
PDF Craftから変換済みのMarkdownをダウンロードし、中身を確認します。アーカイブ形式なら先に展開してください。主要なMarkdown文書を特定し、ローカルのリソースを参照しているのか、リモートのURLを参照しているのか、その両方なのかを見ます。変換のたびに同じフォルダ名になるとは限りません。
.mdファイルをテキストエディタで開き、画像の参照箇所を探します。参照先を見れば、どのリソースを一緒に持っていく必要があるか分かります。images/figure-1.pngのようなパスは、そのMarkdownファイルからの相対パスです。Obsidianが元のPDFから図を自動で取得するための指示ではありません。
ダウンロードしたものは、手を加えていない状態のコピーを残しておきます。移動や名前の変更でリンクが切れたとき、PDFを再度変換しなくても元の構成と見比べられます。
保管庫内の保存先を決める
資料ごとにフォルダを分けます。論文や書籍ごとに1つ、といった具合です。ObsidianのMarkdownインポートのドキュメントでは、ファイルエクスプローラーから追加する方法や、OSのファイルブラウザで保管庫にコピーする方法が説明されています。お使いの端末で利用できる方法に従ってください。
Markdownと必要なリソースは、相対的な構成を保ったまま一緒に移動します。すべてのプロジェクトの画像をimage1.pngのような名前で1つのディレクトリに集めるのは避けましょう。同じ名前が衝突したり、どの資料の画像か分からなくなったりします。
Obsidianには、新しく追加した添付ファイルの保存先を決める設定があります。ただし、この設定があっても、取り込んだMarkdownに書かれた既存のパスがすべて書き換わるわけではありません。リソースのフォルダを整理する前に、実際に取り込まれた参照を確認してください。
保管庫の中で見出し・リンク・画像を確認する
ノートをリーディングビューで開き、アウトラインを確認します。見出しは元資料の節を表しているべきで、ページごとに繰り返されるヘッダーが並んでいてはいけません。続いて、文書内の節へのリンク、ノートへの参照、外部の引用リンクをそれぞれたどってみます。
冒頭付近の画像と、後半の画像を1つずつ見ます。キャプションと図の参照を、元のPDFと照らし合わせてください。ノートにサムネイルが表示されていても、画像全体や重要なラベルが正しく残っている証拠にはなりません。
画像が表示されない場合は、リンクの大文字・小文字、拡張子、フォルダの位置を確認します。ローカルのファイルを想定しているのか、ネットワークへのリクエストなのかを判断してください。壊れたローカルパスを、無関係なWeb上の画像に黙って差し替えて直すのはやめましょう。
対応している添付ファイルの扱いについては、Obsidianの添付ファイルガイドを参照してください。ファイル管理全般の問題については、Markdownの画像リソースで詳しく扱っています。
引用は元のPDFと結びつけておく
タイトル、著者または出版社、版や日付、元のファイル名、該当するページの位置をまとめた短い出典ノートを付けます。印刷されたページ番号とPDFビューアのカウントが食い違う場合は、その違いも書き留めておきます。
元のPDFは、リサーチの作業中にいつでも開ける安定した場所に保管します。保管庫の外に置く場合は、保管庫を別の端末へ移したときにどうなるかを考えておきましょう。あるパソコンで開けたリンクが、別の環境では開けないことがあります。
変換された箇所を引用する前に、PDFと照合します。OCRの誤りも、正しいテキストと同じように検索・取得されてしまいます。検索できるノートは、それだけで検証済みの引用になるわけではありません。
確認が済んだら、取り込んだ内容を役立つノートにする
出典ノートが機能するようになったら、必要なアイデアごとに短いノートを作ります。主張だけを切り取って無関係なファイルに貼り付けるのではなく、出典とページの参照も一緒に引き継いでください。
表なら、見出し、単位、注記があればそれも残します。数式なら、式そのものと表示先のレンダラーを確認してから頼りにします。整理のつもりが、不確かな箇所を確定した事実のように見せてしまわないようにしてください。
次の段階については、PDFからMarkdownへのリサーチ手順とスキャンした書籍をノートにするガイドで説明しています。まずは再現できる取り込みを目指しましょう。保管庫を閉じて開き直したあとも、ノート、リソース、PDFへ戻る経路がそれぞれ機能している必要があります。