2段組の論文は、単語自体は正しく認識されていても、順序が入れ替わって出力されることがあります。抽出されたテキストが左段から始まり、右段のキャプションへ飛び、また元の文の続きに戻る、といった具合です。誤字を直しても、論旨の流れは元に戻りません。
読み順は、ブロック同士の関係として確認してください。必要なのはスペルチェッカーや語数カウントだけではなく、元のPDFと変換結果を並べて見比べることです。
1ページの中に読み進む経路を描く
通常の2段組に加えて見出しがあり、図か表が少なくとも1つあるページを選びます。まずは著者が意図した順序で読んでみてください。左から右へ読む一般的な論文なら、多くの場合、左段を下まで読んでから右段を下まで進みます。ただし、全幅の見出しや図が入ると、このパターンは途切れます。
ノートに短い経路を書いてみましょう。たとえば次のようなものです。
節見出し → 左上の段落 → 左下の段落 → 右上の続き → 次の節。
これは確認用の地図であり、PDFが実際にどう符号化されているかを示すものではありません。1段組と2段組が同じページ内で切り替わることもあります。後続の節が2段組でも、要旨だけがページ全体に広がっている場合もあります。
変換後のテキストで、経路に書いた各段落の冒頭数語を探します。順序が一致しているかを確かめてください。一致しない場合は、段落をやみくもに動かすのではなく、2つの版が最初に食い違う箇所を特定します。
全幅の見出しは区切りとして扱う
両方の段にまたがる見出しは、多くの場合、新しい読み取り領域の始まりを示します。変換結果の中で、その見出しが両段の前に来ているか、左段の途中に入り込んでいるか、あるいは本来は見出しの下にあるべきテキストの後に来ていないかを確認します。
見出しの直前の段落と直後の最初の段落を比べてください。見出し単体では正しく見えても、区切るべきでない2つのブロックを分断していることがあります。ページごとに繰り返される柱（running title）も落とし穴です。抽出ツールがこれを繰り返し現れる節見出しとみなすことがあります。
囲み記事がある論文では、本文の論旨と囲み内の別のテキストを区別します。縦位置が重なっているというだけで、無関係な文の途中に定義や補足記事を差し込まないようにしてください。
図表が本文のどこに入るかを確認する
「図3を参照」といった参照から、実際の図とそのキャプションをたどります。テキストの再配置で位置が変わっても、キャプションは対応する図と一緒に配置されている必要があります。
幅の広い表が、ページの左右の段の間に置かれていることがあります。その直後のテキストが左段の続きなのか、新しい小節の始まりなのか、それとも右段の再開なのかを見ます。変換結果は表の値をすべて保持していても、表全体を段落の途中に置いてしまうことがあります。
確認する図ごとに、次の点を比べてください。
- 図番号と、本文中の参照。
- キャプションの始まりと終わり。
- 図を読み解くのに必要なラベル。
- 挿入位置の直前と直後の段落。
図の物理的な近さだけを判断材料にしないでください。著者が図について、それが印刷されたページより前で論じることも、後で論じることもあります。
段落の中だけでなく、つなぎ目をまたいで読む
順序の誤りは、ほとんどが境界で表面化します。左段の末尾2文と右段の冒頭2文を続けて読みます。次に、ページをまたぐ箇所でも同じことをします。
話題が突然変わる、代名詞の指す対象が不明になる、導入なしに数式が現れる、キャプションが文の中に埋め込まれる、といった兆候に注意してください。印刷行の末尾のハイフンは単語をつなぐこともありますが、もともと複合語の一部であることもあります。元のPDFを確認してからつなぎ直してください。
記録は簡潔にまとめます。元PDFのページ、段落の冒頭、誤って隣接しているブロック、本来隣接すべきブロック、修正案の5項目です。これがあれば、キャプションが1か所ずれただけなのか、論文全体で順序の問題が繰り返されているのかを区別できます。Markdownの読み順トラブルシューティングガイドでは、こうした出力上の症状から確認を始めています。
修正するならMarkdown、読むならEPUB
PDFをMarkdownに変換すると、ブロックの移動、見出しの復元、エディタでの研究ノートの整理に役立ちます。PDFをアップロードし、タスク設定でMarkdownを選んで変換を実行してください。PDF Craftは段組みを含むレイアウトの処理と文字認識を行いますが、複雑なページはやはり目視での確認が必要です。
じっくり読みたい、文字サイズを変えて読みたいという場合はEPUBを選びます。流し込みでは位置が変わるため、印刷ページ番号の一致を合格基準にするのは適切ではありません。代わりに内容の順序を比べてください。どちらの出力を選んでも、図や引用の確認用に元のPDFは手元に残しておきます。
変換結果をノート集に取り込む前に、きれいな1ページ目だけを見て終わりにしないでください。全幅の見出しがあるページ、2段組が密集したページ、幅の広い表、文書の末尾をそれぞれ抜き出して確認します。そのうえで研究用Markdownのワークフローに沿って、元資料をノートと一緒に保管しておきましょう。